Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms