Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCG2P13521 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCG2P13521 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCG2P13521 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCG2P13521 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCG2P13521 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SCG2P13521 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCG2P13521 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCG2P13521 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCG2P13521 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCG2P13521 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCG2P13521 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCG2P13521 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCG2P13521 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCG2P13521 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCG2P13521 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCG2P13521 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCG2P13521 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCG2P13521 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCG2P13521 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCG2P13521 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCG2P13521 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCG2P13521 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCG2P13521 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCG2P13521 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCG2P13521 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCG2P13521 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCG2P13521 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCG2P13521 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCG2P13521 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCG2P13521 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCG2P13521 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCG2P13521 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCG2P13521 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCG2P13521 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCG2P13521 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCG2P13521 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCG2P13521 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCG2P13521 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCG2P13521 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCG2P13521 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCG2P13521 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCG2P13521 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SCG2P13521 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCG2P13521 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCG2P13521 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCG2P13521 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCG2P13521 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCG2P13521 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCG2P13521 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCG2P13521 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCG2P13521 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCG2P13521 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SCG2P13521 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCG2P13521 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCG2P13521 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCG2P13521 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCG2P13521 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCG2P13521 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCG2P13521 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCG2P13521 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCG2P13521 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SCG2P13521 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCG2P13521 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCG2P13521 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCG2P13521 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCG2P13521 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCG2P13521 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCG2P13521 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCG2P13521 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCG2P13521 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCG2P13521 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCG2P13521 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCG2P13521 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCG2P13521 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCG2P13521 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCG2P13521 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCG2P13521 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SCG2P13521 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCG2P13521 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCG2P13521 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SCG2P13521 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCG2P13521 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCG2P13521 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCG2P13521 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCG2P13521 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SCG2P13521 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCG2P13521 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCG2P13521 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCG2P13521 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCG2P13521 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCG2P13521 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCG2P13521 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCG2P13521 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCG2P13521 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCG2P13521 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCG2P13521 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCG2P13521 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCG2P13521 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCG2P13521 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms