Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
TOP2AP11388 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
TOP2AP11388 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
TOP2AP11388 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC36.02■■■■□ 3.36
TOP2AP11388 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
TOP2AP11388 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
TOP2AP11388 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
TOP2AP11388 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC36.02■■■■□ 3.36
TOP2AP11388 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
TOP2AP11388 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
TOP2AP11388 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
TOP2AP11388 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
TOP2AP11388 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
TOP2AP11388 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
TOP2AP11388 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
TOP2AP11388 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
TOP2AP11388 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
TOP2AP11388 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
TOP2AP11388 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
TOP2AP11388 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
TOP2AP11388 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
TOP2AP11388 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC36■■■■□ 3.35
TOP2AP11388 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC36■■■■□ 3.35
TOP2AP11388 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC36■■■■□ 3.35
TOP2AP11388 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
TOP2AP11388 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC36■■■■□ 3.35
TOP2AP11388 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
TOP2AP11388 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
TOP2AP11388 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
TOP2AP11388 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
TOP2AP11388 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
TOP2AP11388 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
TOP2AP11388 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
TOP2AP11388 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
TOP2AP11388 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
TOP2AP11388 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
TOP2AP11388 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
TOP2AP11388 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
TOP2AP11388 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
TOP2AP11388 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
TOP2AP11388 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
TOP2AP11388 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
TOP2AP11388 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
TOP2AP11388 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC35.98■■■■□ 3.35
TOP2AP11388 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
TOP2AP11388 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
TOP2AP11388 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
TOP2AP11388 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
TOP2AP11388 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
TOP2AP11388 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
TOP2AP11388 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
TOP2AP11388 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
TOP2AP11388 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
TOP2AP11388 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
TOP2AP11388 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
TOP2AP11388 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
TOP2AP11388 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
TOP2AP11388 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
TOP2AP11388 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
TOP2AP11388 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
TOP2AP11388 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
TOP2AP11388 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
TOP2AP11388 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
TOP2AP11388 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
TOP2AP11388 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
TOP2AP11388 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
TOP2AP11388 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
TOP2AP11388 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
TOP2AP11388 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
TOP2AP11388 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC35.97■■■■□ 3.35
TOP2AP11388 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
TOP2AP11388 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
TOP2AP11388 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
TOP2AP11388 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
TOP2AP11388 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
TOP2AP11388 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
TOP2AP11388 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
TOP2AP11388 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
TOP2AP11388 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
TOP2AP11388 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
TOP2AP11388 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
TOP2AP11388 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC35.95■■■■□ 3.34
TOP2AP11388 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
TOP2AP11388 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
TOP2AP11388 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
TOP2AP11388 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
TOP2AP11388 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
TOP2AP11388 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
TOP2AP11388 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
TOP2AP11388 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
TOP2AP11388 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
TOP2AP11388 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
TOP2AP11388 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
TOP2AP11388 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
TOP2AP11388 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
TOP2AP11388 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
TOP2AP11388 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
TOP2AP11388 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
TOP2AP11388 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
TOP2AP11388 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms