Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CHGAP10645 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CHGAP10645 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CHGAP10645 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CHGAP10645 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CHGAP10645 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CHGAP10645 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHGAP10645 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHGAP10645 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHGAP10645 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHGAP10645 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHGAP10645 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHGAP10645 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHGAP10645 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHGAP10645 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHGAP10645 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHGAP10645 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHGAP10645 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHGAP10645 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHGAP10645 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHGAP10645 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHGAP10645 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHGAP10645 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHGAP10645 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHGAP10645 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CHGAP10645 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHGAP10645 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHGAP10645 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHGAP10645 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHGAP10645 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHGAP10645 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHGAP10645 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHGAP10645 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHGAP10645 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHGAP10645 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHGAP10645 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHGAP10645 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHGAP10645 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHGAP10645 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHGAP10645 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHGAP10645 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHGAP10645 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHGAP10645 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CHGAP10645 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHGAP10645 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHGAP10645 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHGAP10645 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHGAP10645 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHGAP10645 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHGAP10645 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHGAP10645 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHGAP10645 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHGAP10645 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHGAP10645 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHGAP10645 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHGAP10645 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CHGAP10645 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHGAP10645 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHGAP10645 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHGAP10645 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHGAP10645 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHGAP10645 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHGAP10645 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHGAP10645 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHGAP10645 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHGAP10645 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHGAP10645 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHGAP10645 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHGAP10645 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHGAP10645 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHGAP10645 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHGAP10645 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHGAP10645 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHGAP10645 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHGAP10645 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHGAP10645 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHGAP10645 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHGAP10645 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHGAP10645 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHGAP10645 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHGAP10645 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHGAP10645 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHGAP10645 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHGAP10645 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHGAP10645 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHGAP10645 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHGAP10645 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CHGAP10645 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CHGAP10645 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHGAP10645 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHGAP10645 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHGAP10645 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHGAP10645 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHGAP10645 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHGAP10645 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHGAP10645 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHGAP10645 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHGAP10645 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHGAP10645 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHGAP10645 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms