Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCL3P10147 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCL3P10147 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCL3P10147 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCL3P10147 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCL3P10147 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCL3P10147 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCL3P10147 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCL3P10147 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCL3P10147 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCL3P10147 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCL3P10147 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCL3P10147 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCL3P10147 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCL3P10147 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCL3P10147 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCL3P10147 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCL3P10147 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCL3P10147 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCL3P10147 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCL3P10147 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCL3P10147 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCL3P10147 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCL3P10147 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCL3P10147 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCL3P10147 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCL3P10147 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCL3P10147 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCL3P10147 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCL3P10147 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCL3P10147 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCL3P10147 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCL3P10147 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCL3P10147 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCL3P10147 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCL3P10147 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCL3P10147 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCL3P10147 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCL3P10147 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCL3P10147 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCL3P10147 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCL3P10147 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCL3P10147 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCL3P10147 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCL3P10147 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCL3P10147 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCL3P10147 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCL3P10147 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCL3P10147 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCL3P10147 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCL3P10147 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCL3P10147 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCL3P10147 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCL3P10147 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCL3P10147 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCL3P10147 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCL3P10147 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCL3P10147 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCL3P10147 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCL3P10147 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCL3P10147 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCL3P10147 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCL3P10147 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCL3P10147 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCL3P10147 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCL3P10147 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCL3P10147 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCL3P10147 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCL3P10147 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCL3P10147 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCL3P10147 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCL3P10147 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCL3P10147 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCL3P10147 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCL3P10147 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCL3P10147 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCL3P10147 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCL3P10147 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCL3P10147 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCL3P10147 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CCL3P10147 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CCL3P10147 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCL3P10147 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CCL3P10147 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCL3P10147 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCL3P10147 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCL3P10147 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCL3P10147 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCL3P10147 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCL3P10147 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCL3P10147 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCL3P10147 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCL3P10147 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCL3P10147 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCL3P10147 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCL3P10147 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCL3P10147 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCL3P10147 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCL3P10147 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCL3P10147 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms