Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI8

SAA1, Serum amyloid A-1 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA1P0DJI8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAA1P0DJI8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms