Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGAVP06756 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms