Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOA1P02647 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOA1P02647 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOA1P02647 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
APOA1P02647 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
APOA1P02647 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
APOA1P02647 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOA1P02647 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOA1P02647 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOA1P02647 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOA1P02647 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOA1P02647 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOA1P02647 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOA1P02647 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOA1P02647 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOA1P02647 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOA1P02647 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOA1P02647 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOA1P02647 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOA1P02647 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOA1P02647 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOA1P02647 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOA1P02647 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOA1P02647 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOA1P02647 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOA1P02647 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOA1P02647 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOA1P02647 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOA1P02647 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOA1P02647 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOA1P02647 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOA1P02647 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOA1P02647 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOA1P02647 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOA1P02647 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOA1P02647 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
APOA1P02647 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOA1P02647 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOA1P02647 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
APOA1P02647 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOA1P02647 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOA1P02647 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOA1P02647 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOA1P02647 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOA1P02647 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOA1P02647 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOA1P02647 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOA1P02647 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
APOA1P02647 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOA1P02647 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOA1P02647 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOA1P02647 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOA1P02647 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOA1P02647 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOA1P02647 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOA1P02647 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOA1P02647 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOA1P02647 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOA1P02647 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOA1P02647 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
APOA1P02647 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOA1P02647 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOA1P02647 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOA1P02647 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOA1P02647 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOA1P02647 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOA1P02647 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOA1P02647 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOA1P02647 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOA1P02647 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOA1P02647 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOA1P02647 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOA1P02647 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOA1P02647 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
APOA1P02647 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOA1P02647 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOA1P02647 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOA1P02647 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOA1P02647 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOA1P02647 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOA1P02647 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOA1P02647 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOA1P02647 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOA1P02647 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOA1P02647 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOA1P02647 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOA1P02647 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOA1P02647 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOA1P02647 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOA1P02647 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOA1P02647 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOA1P02647 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOA1P02647 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOA1P02647 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOA1P02647 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOA1P02647 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOA1P02647 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOA1P02647 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
APOA1P02647 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
APOA1P02647 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms