Protein–RNA interactions for Protein: P01599

IGKV1-17, Immunoglobulin kappa variable 1-17, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-17P01599 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms