Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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