Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX58O95786 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX58O95786 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX58O95786 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX58O95786 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX58O95786 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX58O95786 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX58O95786 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX58O95786 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX58O95786 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX58O95786 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX58O95786 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX58O95786 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX58O95786 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX58O95786 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX58O95786 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX58O95786 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX58O95786 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX58O95786 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX58O95786 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX58O95786 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX58O95786 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX58O95786 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX58O95786 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX58O95786 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX58O95786 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX58O95786 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX58O95786 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX58O95786 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX58O95786 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX58O95786 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX58O95786 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX58O95786 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX58O95786 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX58O95786 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX58O95786 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX58O95786 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX58O95786 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX58O95786 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX58O95786 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX58O95786 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX58O95786 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX58O95786 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX58O95786 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX58O95786 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX58O95786 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX58O95786 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX58O95786 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX58O95786 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX58O95786 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX58O95786 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX58O95786 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX58O95786 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX58O95786 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX58O95786 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX58O95786 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX58O95786 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX58O95786 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX58O95786 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX58O95786 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX58O95786 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX58O95786 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX58O95786 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX58O95786 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX58O95786 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX58O95786 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX58O95786 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX58O95786 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX58O95786 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX58O95786 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX58O95786 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX58O95786 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX58O95786 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX58O95786 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX58O95786 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX58O95786 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX58O95786 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX58O95786 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX58O95786 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX58O95786 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX58O95786 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX58O95786 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX58O95786 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX58O95786 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX58O95786 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX58O95786 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX58O95786 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX58O95786 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX58O95786 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX58O95786 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX58O95786 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX58O95786 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX58O95786 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX58O95786 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX58O95786 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX58O95786 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX58O95786 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX58O95786 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX58O95786 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX58O95786 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms