Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POP4O95707 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POP4O95707 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POP4O95707 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POP4O95707 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POP4O95707 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POP4O95707 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POP4O95707 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POP4O95707 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
POP4O95707 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POP4O95707 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POP4O95707 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POP4O95707 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POP4O95707 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POP4O95707 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POP4O95707 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POP4O95707 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POP4O95707 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POP4O95707 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POP4O95707 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POP4O95707 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POP4O95707 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POP4O95707 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POP4O95707 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POP4O95707 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POP4O95707 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POP4O95707 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POP4O95707 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POP4O95707 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POP4O95707 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POP4O95707 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POP4O95707 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POP4O95707 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POP4O95707 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POP4O95707 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POP4O95707 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POP4O95707 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POP4O95707 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POP4O95707 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POP4O95707 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POP4O95707 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POP4O95707 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POP4O95707 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POP4O95707 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POP4O95707 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POP4O95707 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POP4O95707 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POP4O95707 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POP4O95707 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POP4O95707 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POP4O95707 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POP4O95707 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POP4O95707 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POP4O95707 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POP4O95707 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POP4O95707 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
POP4O95707 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POP4O95707 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POP4O95707 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
POP4O95707 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POP4O95707 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POP4O95707 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POP4O95707 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POP4O95707 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POP4O95707 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POP4O95707 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POP4O95707 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POP4O95707 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POP4O95707 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POP4O95707 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POP4O95707 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POP4O95707 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
POP4O95707 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POP4O95707 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POP4O95707 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
POP4O95707 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POP4O95707 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POP4O95707 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POP4O95707 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POP4O95707 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
POP4O95707 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POP4O95707 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POP4O95707 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POP4O95707 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POP4O95707 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POP4O95707 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POP4O95707 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POP4O95707 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POP4O95707 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POP4O95707 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POP4O95707 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POP4O95707 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POP4O95707 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POP4O95707 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
POP4O95707 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POP4O95707 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
POP4O95707 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POP4O95707 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POP4O95707 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POP4O95707 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms