Protein–RNA interactions for Protein: O75503

CLN5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN5O75503 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN5O75503 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN5O75503 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN5O75503 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN5O75503 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN5O75503 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN5O75503 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN5O75503 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN5O75503 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN5O75503 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN5O75503 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN5O75503 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN5O75503 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN5O75503 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN5O75503 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN5O75503 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN5O75503 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN5O75503 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN5O75503 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN5O75503 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN5O75503 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN5O75503 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN5O75503 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN5O75503 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN5O75503 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN5O75503 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN5O75503 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN5O75503 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN5O75503 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN5O75503 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN5O75503 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN5O75503 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN5O75503 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLN5O75503 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLN5O75503 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLN5O75503 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLN5O75503 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLN5O75503 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLN5O75503 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLN5O75503 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLN5O75503 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLN5O75503 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLN5O75503 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLN5O75503 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLN5O75503 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLN5O75503 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN5O75503 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN5O75503 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN5O75503 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN5O75503 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN5O75503 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN5O75503 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN5O75503 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN5O75503 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN5O75503 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN5O75503 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN5O75503 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN5O75503 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN5O75503 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN5O75503 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN5O75503 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN5O75503 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN5O75503 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN5O75503 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN5O75503 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN5O75503 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN5O75503 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN5O75503 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN5O75503 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN5O75503 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN5O75503 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN5O75503 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN5O75503 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN5O75503 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN5O75503 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN5O75503 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN5O75503 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN5O75503 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN5O75503 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN5O75503 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN5O75503 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN5O75503 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN5O75503 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN5O75503 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN5O75503 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN5O75503 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN5O75503 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN5O75503 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN5O75503 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN5O75503 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN5O75503 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN5O75503 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN5O75503 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN5O75503 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN5O75503 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN5O75503 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN5O75503 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN5O75503 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN5O75503 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN5O75503 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms