Protein–RNA interactions for Protein: O75446

SAP30, Histone deacetylase complex subunit SAP30, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAP30O75446 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAP30O75446 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAP30O75446 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAP30O75446 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAP30O75446 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAP30O75446 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SAP30O75446 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAP30O75446 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAP30O75446 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAP30O75446 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAP30O75446 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAP30O75446 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAP30O75446 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAP30O75446 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAP30O75446 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAP30O75446 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAP30O75446 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAP30O75446 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAP30O75446 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAP30O75446 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SAP30O75446 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SAP30O75446 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAP30O75446 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAP30O75446 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SAP30O75446 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAP30O75446 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAP30O75446 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAP30O75446 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAP30O75446 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAP30O75446 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAP30O75446 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAP30O75446 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAP30O75446 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAP30O75446 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAP30O75446 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAP30O75446 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAP30O75446 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAP30O75446 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAP30O75446 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAP30O75446 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SAP30O75446 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAP30O75446 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAP30O75446 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAP30O75446 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAP30O75446 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAP30O75446 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAP30O75446 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAP30O75446 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAP30O75446 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAP30O75446 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAP30O75446 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAP30O75446 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAP30O75446 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAP30O75446 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SAP30O75446 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAP30O75446 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAP30O75446 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAP30O75446 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAP30O75446 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SAP30O75446 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAP30O75446 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAP30O75446 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAP30O75446 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAP30O75446 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAP30O75446 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAP30O75446 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAP30O75446 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAP30O75446 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAP30O75446 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAP30O75446 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAP30O75446 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAP30O75446 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAP30O75446 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAP30O75446 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAP30O75446 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAP30O75446 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAP30O75446 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAP30O75446 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAP30O75446 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAP30O75446 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAP30O75446 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAP30O75446 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAP30O75446 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAP30O75446 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAP30O75446 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SAP30O75446 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAP30O75446 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAP30O75446 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAP30O75446 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAP30O75446 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAP30O75446 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAP30O75446 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAP30O75446 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAP30O75446 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAP30O75446 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAP30O75446 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAP30O75446 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAP30O75446 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAP30O75446 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAP30O75446 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms