Protein–RNA interactions for Protein: O75177

SS18L1, Calcium-responsive transactivator, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L1O75177 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SS18L1O75177 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SS18L1O75177 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SS18L1O75177 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SS18L1O75177 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SS18L1O75177 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SS18L1O75177 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SS18L1O75177 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SS18L1O75177 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SS18L1O75177 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SS18L1O75177 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SS18L1O75177 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SS18L1O75177 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SS18L1O75177 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SS18L1O75177 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SS18L1O75177 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SS18L1O75177 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SS18L1O75177 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SS18L1O75177 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SS18L1O75177 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SS18L1O75177 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SS18L1O75177 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SS18L1O75177 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SS18L1O75177 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SS18L1O75177 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SS18L1O75177 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SS18L1O75177 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SS18L1O75177 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SS18L1O75177 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SS18L1O75177 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SS18L1O75177 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SS18L1O75177 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SS18L1O75177 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SS18L1O75177 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SS18L1O75177 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SS18L1O75177 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SS18L1O75177 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SS18L1O75177 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SS18L1O75177 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SS18L1O75177 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SS18L1O75177 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SS18L1O75177 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SS18L1O75177 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SS18L1O75177 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SS18L1O75177 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SS18L1O75177 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SS18L1O75177 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SS18L1O75177 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SS18L1O75177 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SS18L1O75177 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SS18L1O75177 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SS18L1O75177 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SS18L1O75177 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SS18L1O75177 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SS18L1O75177 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SS18L1O75177 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SS18L1O75177 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SS18L1O75177 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SS18L1O75177 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SS18L1O75177 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SS18L1O75177 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SS18L1O75177 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SS18L1O75177 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SS18L1O75177 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SS18L1O75177 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SS18L1O75177 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SS18L1O75177 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SS18L1O75177 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SS18L1O75177 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SS18L1O75177 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SS18L1O75177 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SS18L1O75177 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SS18L1O75177 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SS18L1O75177 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SS18L1O75177 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SS18L1O75177 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SS18L1O75177 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SS18L1O75177 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms