Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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PDE6DO43924 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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PDE6DO43924 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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PDE6DO43924 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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PDE6DO43924 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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PDE6DO43924 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
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PDE6DO43924 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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PDE6DO43924 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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PDE6DO43924 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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