Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CREB3O43889 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CREB3O43889 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CREB3O43889 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CREB3O43889 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CREB3O43889 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CREB3O43889 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CREB3O43889 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CREB3O43889 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CREB3O43889 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CREB3O43889 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CREB3O43889 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CREB3O43889 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CREB3O43889 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CREB3O43889 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CREB3O43889 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CREB3O43889 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CREB3O43889 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CREB3O43889 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CREB3O43889 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CREB3O43889 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CREB3O43889 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CREB3O43889 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CREB3O43889 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CREB3O43889 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CREB3O43889 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CREB3O43889 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CREB3O43889 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CREB3O43889 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CREB3O43889 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CREB3O43889 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CREB3O43889 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CREB3O43889 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CREB3O43889 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CREB3O43889 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CREB3O43889 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CREB3O43889 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CREB3O43889 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CREB3O43889 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CREB3O43889 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CREB3O43889 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CREB3O43889 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CREB3O43889 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CREB3O43889 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CREB3O43889 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CREB3O43889 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CREB3O43889 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CREB3O43889 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CREB3O43889 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CREB3O43889 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CREB3O43889 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CREB3O43889 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CREB3O43889 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CREB3O43889 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CREB3O43889 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CREB3O43889 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CREB3O43889 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CREB3O43889 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CREB3O43889 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CREB3O43889 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CREB3O43889 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CREB3O43889 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CREB3O43889 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CREB3O43889 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CREB3O43889 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CREB3O43889 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CREB3O43889 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CREB3O43889 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CREB3O43889 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CREB3O43889 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CREB3O43889 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CREB3O43889 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CREB3O43889 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CREB3O43889 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CREB3O43889 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CREB3O43889 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CREB3O43889 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CREB3O43889 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CREB3O43889 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CREB3O43889 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CREB3O43889 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CREB3O43889 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CREB3O43889 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CREB3O43889 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CREB3O43889 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CREB3O43889 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CREB3O43889 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CREB3O43889 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CREB3O43889 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CREB3O43889 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CREB3O43889 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CREB3O43889 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CREB3O43889 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CREB3O43889 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CREB3O43889 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CREB3O43889 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CREB3O43889 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CREB3O43889 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CREB3O43889 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CREB3O43889 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms