Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTN4O43707 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms