Protein–RNA interactions for Protein: O43439

CBFA2T2, Protein CBFA2T2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFA2T2O43439 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms