Protein–RNA interactions for Protein: O15541

RNF113A, RING finger protein 113A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF113AO15541 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF113AO15541 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF113AO15541 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF113AO15541 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF113AO15541 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF113AO15541 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF113AO15541 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF113AO15541 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF113AO15541 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF113AO15541 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF113AO15541 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF113AO15541 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF113AO15541 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF113AO15541 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF113AO15541 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF113AO15541 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF113AO15541 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF113AO15541 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF113AO15541 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF113AO15541 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF113AO15541 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF113AO15541 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF113AO15541 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF113AO15541 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF113AO15541 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF113AO15541 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF113AO15541 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF113AO15541 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF113AO15541 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF113AO15541 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF113AO15541 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF113AO15541 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF113AO15541 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF113AO15541 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF113AO15541 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF113AO15541 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF113AO15541 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF113AO15541 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF113AO15541 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF113AO15541 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF113AO15541 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF113AO15541 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF113AO15541 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF113AO15541 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF113AO15541 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF113AO15541 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF113AO15541 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF113AO15541 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF113AO15541 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF113AO15541 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF113AO15541 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF113AO15541 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF113AO15541 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF113AO15541 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF113AO15541 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF113AO15541 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF113AO15541 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF113AO15541 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF113AO15541 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF113AO15541 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF113AO15541 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF113AO15541 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF113AO15541 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF113AO15541 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF113AO15541 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF113AO15541 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF113AO15541 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF113AO15541 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF113AO15541 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF113AO15541 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RNF113AO15541 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF113AO15541 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF113AO15541 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF113AO15541 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF113AO15541 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF113AO15541 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF113AO15541 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF113AO15541 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF113AO15541 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF113AO15541 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF113AO15541 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF113AO15541 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF113AO15541 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF113AO15541 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF113AO15541 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF113AO15541 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF113AO15541 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF113AO15541 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF113AO15541 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF113AO15541 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF113AO15541 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF113AO15541 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF113AO15541 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF113AO15541 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF113AO15541 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF113AO15541 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF113AO15541 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF113AO15541 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF113AO15541 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF113AO15541 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms