Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
VGFO15240 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
VGFO15240 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
VGFO15240 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
VGFO15240 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
VGFO15240 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
VGFO15240 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
VGFO15240 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
VGFO15240 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
VGFO15240 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
VGFO15240 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
VGFO15240 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
VGFO15240 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
VGFO15240 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
VGFO15240 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
VGFO15240 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
VGFO15240 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
VGFO15240 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
VGFO15240 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
VGFO15240 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
VGFO15240 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
VGFO15240 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
VGFO15240 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
VGFO15240 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
VGFO15240 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
VGFO15240 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
VGFO15240 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
VGFO15240 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
VGFO15240 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
VGFO15240 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
VGFO15240 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
VGFO15240 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
VGFO15240 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
VGFO15240 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
VGFO15240 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
VGFO15240 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
VGFO15240 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
VGFO15240 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
VGFO15240 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
VGFO15240 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
VGFO15240 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
VGFO15240 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
VGFO15240 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
VGFO15240 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
VGFO15240 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
VGFO15240 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
VGFO15240 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
VGFO15240 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
VGFO15240 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
VGFO15240 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
VGFO15240 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
VGFO15240 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
VGFO15240 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
VGFO15240 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
VGFO15240 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
VGFO15240 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
VGFO15240 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
VGFO15240 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
VGFO15240 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
VGFO15240 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
VGFO15240 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
VGFO15240 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
VGFO15240 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
VGFO15240 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
VGFO15240 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
VGFO15240 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
VGFO15240 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
VGFO15240 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
VGFO15240 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
VGFO15240 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
VGFO15240 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
VGFO15240 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
VGFO15240 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
VGFO15240 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
VGFO15240 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
VGFO15240 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
VGFO15240 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
VGFO15240 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
VGFO15240 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
VGFO15240 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
VGFO15240 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
VGFO15240 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
VGFO15240 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
VGFO15240 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
VGFO15240 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
VGFO15240 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
VGFO15240 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
VGFO15240 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
VGFO15240 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
VGFO15240 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
VGFO15240 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
VGFO15240 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
VGFO15240 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
VGFO15240 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
VGFO15240 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
VGFO15240 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
VGFO15240 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
VGFO15240 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
VGFO15240 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
VGFO15240 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms