Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR1CO15160 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR1CO15160 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR1CO15160 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR1CO15160 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR1CO15160 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR1CO15160 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR1CO15160 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR1CO15160 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR1CO15160 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR1CO15160 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR1CO15160 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR1CO15160 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR1CO15160 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR1CO15160 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR1CO15160 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR1CO15160 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR1CO15160 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR1CO15160 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR1CO15160 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR1CO15160 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR1CO15160 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR1CO15160 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR1CO15160 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR1CO15160 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR1CO15160 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR1CO15160 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR1CO15160 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR1CO15160 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR1CO15160 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR1CO15160 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR1CO15160 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR1CO15160 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR1CO15160 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR1CO15160 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR1CO15160 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR1CO15160 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR1CO15160 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR1CO15160 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR1CO15160 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR1CO15160 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR1CO15160 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR1CO15160 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLR1CO15160 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLR1CO15160 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLR1CO15160 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLR1CO15160 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms