Protein–RNA interactions for Protein: O14983

ATP2A1, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A1O14983 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP2A1O14983 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2A1O14983 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms