Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PIK3C2AO00443 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms