Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIP1O00291 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIP1O00291 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIP1O00291 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIP1O00291 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIP1O00291 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIP1O00291 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIP1O00291 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIP1O00291 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIP1O00291 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIP1O00291 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIP1O00291 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIP1O00291 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIP1O00291 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIP1O00291 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIP1O00291 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIP1O00291 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIP1O00291 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIP1O00291 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIP1O00291 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIP1O00291 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIP1O00291 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HIP1O00291 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIP1O00291 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HIP1O00291 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIP1O00291 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIP1O00291 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIP1O00291 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIP1O00291 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIP1O00291 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIP1O00291 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIP1O00291 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIP1O00291 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIP1O00291 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIP1O00291 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIP1O00291 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIP1O00291 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HIP1O00291 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIP1O00291 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIP1O00291 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIP1O00291 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIP1O00291 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HIP1O00291 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIP1O00291 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HIP1O00291 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIP1O00291 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIP1O00291 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIP1O00291 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIP1O00291 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIP1O00291 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIP1O00291 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIP1O00291 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HIP1O00291 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HIP1O00291 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HIP1O00291 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HIP1O00291 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HIP1O00291 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HIP1O00291 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HIP1O00291 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HIP1O00291 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HIP1O00291 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HIP1O00291 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HIP1O00291 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HIP1O00291 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HIP1O00291 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HIP1O00291 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HIP1O00291 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HIP1O00291 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HIP1O00291 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HIP1O00291 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HIP1O00291 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HIP1O00291 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HIP1O00291 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HIP1O00291 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HIP1O00291 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HIP1O00291 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HIP1O00291 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HIP1O00291 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HIP1O00291 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HIP1O00291 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HIP1O00291 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HIP1O00291 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HIP1O00291 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HIP1O00291 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HIP1O00291 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HIP1O00291 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HIP1O00291 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HIP1O00291 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HIP1O00291 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HIP1O00291 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HIP1O00291 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HIP1O00291 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HIP1O00291 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HIP1O00291 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HIP1O00291 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HIP1O00291 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HIP1O00291 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HIP1O00291 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HIP1O00291 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HIP1O00291 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms