Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PATL2C9JE40 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms