Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPBD1B2RD01 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPBD1B2RD01 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms