Protein–RNA interactions for Protein: A6NLX3

SPDYE4, Speedy protein E4, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYE4A6NLX3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 LST1-205ENST00000376089 680 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 LST1-206ENST00000376090 689 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 LST1-209ENST00000376096 565 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 LST1-210ENST00000376099 610 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 LST1-212ENST00000396101 459 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 LST1-214ENST00000418507 726 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 KRTAP4-4-201ENST00000390661 1081 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms