Protein–RNA interactions for Protein: A6NKB5

PCNX2, Pecanex-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX2A6NKB5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PCNX2A6NKB5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PCNX2A6NKB5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCNX2A6NKB5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCNX2A6NKB5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCNX2A6NKB5 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCNX2A6NKB5 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCNX2A6NKB5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCNX2A6NKB5 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCNX2A6NKB5 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCNX2A6NKB5 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCNX2A6NKB5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCNX2A6NKB5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCNX2A6NKB5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCNX2A6NKB5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCNX2A6NKB5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCNX2A6NKB5 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCNX2A6NKB5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCNX2A6NKB5 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCNX2A6NKB5 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCNX2A6NKB5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCNX2A6NKB5 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCNX2A6NKB5 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PCNX2A6NKB5 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PCNX2A6NKB5 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PCNX2A6NKB5 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PCNX2A6NKB5 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PCNX2A6NKB5 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PCNX2A6NKB5 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PCNX2A6NKB5 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PCNX2A6NKB5 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PCNX2A6NKB5 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PCNX2A6NKB5 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PCNX2A6NKB5 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PCNX2A6NKB5 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PCNX2A6NKB5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PCNX2A6NKB5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PCNX2A6NKB5 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PCNX2A6NKB5 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PCNX2A6NKB5 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PCNX2A6NKB5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PCNX2A6NKB5 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PCNX2A6NKB5 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PCNX2A6NKB5 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PCNX2A6NKB5 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PCNX2A6NKB5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PCNX2A6NKB5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PCNX2A6NKB5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PCNX2A6NKB5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PCNX2A6NKB5 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PCNX2A6NKB5 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PCNX2A6NKB5 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PCNX2A6NKB5 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PCNX2A6NKB5 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PCNX2A6NKB5 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PCNX2A6NKB5 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PCNX2A6NKB5 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PCNX2A6NKB5 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PCNX2A6NKB5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PCNX2A6NKB5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PCNX2A6NKB5 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PCNX2A6NKB5 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PCNX2A6NKB5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PCNX2A6NKB5 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PCNX2A6NKB5 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PCNX2A6NKB5 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PCNX2A6NKB5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PCNX2A6NKB5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PCNX2A6NKB5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PCNX2A6NKB5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PCNX2A6NKB5 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PCNX2A6NKB5 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PCNX2A6NKB5 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PCNX2A6NKB5 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PCNX2A6NKB5 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PCNX2A6NKB5 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PCNX2A6NKB5 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PCNX2A6NKB5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PCNX2A6NKB5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PCNX2A6NKB5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PCNX2A6NKB5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCNX2A6NKB5 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCNX2A6NKB5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCNX2A6NKB5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCNX2A6NKB5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCNX2A6NKB5 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCNX2A6NKB5 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCNX2A6NKB5 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCNX2A6NKB5 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PCNX2A6NKB5 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCNX2A6NKB5 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCNX2A6NKB5 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCNX2A6NKB5 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCNX2A6NKB5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCNX2A6NKB5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCNX2A6NKB5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCNX2A6NKB5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PCNX2A6NKB5 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCNX2A6NKB5 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCNX2A6NKB5 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms