Protein–RNA interactions for Protein: A6NK53

ZNF233, Zinc finger protein 233, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF233A6NK53 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF233A6NK53 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF233A6NK53 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF233A6NK53 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF233A6NK53 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF233A6NK53 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF233A6NK53 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF233A6NK53 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF233A6NK53 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF233A6NK53 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF233A6NK53 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF233A6NK53 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF233A6NK53 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF233A6NK53 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF233A6NK53 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF233A6NK53 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF233A6NK53 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF233A6NK53 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF233A6NK53 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF233A6NK53 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF233A6NK53 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF233A6NK53 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF233A6NK53 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF233A6NK53 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF233A6NK53 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF233A6NK53 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF233A6NK53 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms