Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GOLGA6L4A6NEF3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms