Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
VWA8A3KMH1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VWA8A3KMH1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms