Protein–RNA interactions for Protein: A0PK11

CLRN2, Clarin-2, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN2A0PK11 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLRN2A0PK11 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLRN2A0PK11 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms