Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0U1RQF3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms