Protein–RNA interactions for Protein: P43088

PTGFR, Prostaglandin F2-alpha receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRP43088 MEG8-205ENST00000442197 625 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 ATP6V1G1P3-201ENST00000442568 280 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 AL135924.1-201ENST00000446146 423 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 HCG25-220ENST00000450514 759 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 HNRNPA3P2-201ENST00000451198 662 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 HNRNPA1P43-201ENST00000452680 910 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 AC104619.1-201ENST00000459634 631 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 CTLA4-204ENST00000472206 277 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 RN7SL507P-201ENST00000474076 296 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 RN7SL159P-201ENST00000485164 292 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 RPL29P11-201ENST00000494408 492 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 LINC01259-201ENST00000507056 757 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 CARD8-224ENST00000522431 622 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 AL020996.2-202ENST00000527604 334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 BOLA3P1-201ENST00000530713 355 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 AP001767.1-201ENST00000530976 286 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 AC005842.1-201ENST00000537149 678 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 AC004801.5-201ENST00000552958 550 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 AC023855.1-201ENST00000585899 359 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 AC092634.5-207ENST00000596569 805 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 AC116003.3-201ENST00000612669 541 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 HOXA11-AS1_2.1-201ENST00000615604 187 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 HIST1H4L-201ENST00000618305 312 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 AC108125.1-201ENST00000622310 543 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 MIR6880-201ENST00000622851 62 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 AC239585.2-201ENST00000624269 557 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 CU633904.1-204ENST00000624907 777 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 AL353649.1-201ENST00000625060 619 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 BRCC3-210ENST00000630295 954 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 PPARG-209ENST00000397026 2029 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 TTC23-202ENST00000394129 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 EPHB2-201ENST00000374627 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 ZFP57-201ENST00000376881 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 AC105233.5-202ENST00000642083 4132 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 PPARA-203ENST00000407236 9995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 DOCK11-202ENST00000276204 6664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 FAM13A-202ENST00000395002 4945 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 UTP15-202ENST00000508491 1828 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 KIAA1328-203ENST00000586501 1577 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 DLG2-202ENST00000330014 2789 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 FUT10-206ENST00000518672 3115 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 ERG-206ENST00000398911 4914 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 DYNLT1-202ENST00000367088 2891 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 COL24A1-201ENST00000370571 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 PRSS51-203ENST00000636217 2255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 CSTF3-AS1-201ENST00000500025 2031 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 CCPG1-212ENST00000569205 2970 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 SEPT4-202ENST00000317268 1784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 XRCC6P5-201ENST00000435236 1795 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 RAD18-201ENST00000264926 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 SFR1-202ENST00000369729 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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PTGFRP43088 DLG1-202ENST00000357674 4931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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PTGFRP43088 UBE2C-205ENST00000372568 914 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 RGS10-203ENST00000392865 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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PTGFRP43088 SCIMP-201ENST00000399600 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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PTGFRP43088 AC026369.3-201ENST00000540226 586 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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PTGFRP43088 AC080037.1-201ENST00000584975 889 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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PTGFRP43088 OR1B1-201ENST00000623530 995 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 AL358790.1-202ENST00000632794 583 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 MICAL3-219ENST00000585038 3323 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 EEF1A1P6-201ENST00000434005 1384 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 KIF21A-204ENST00000544797 5040 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 ALMS1-206ENST00000613296 12925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 LRRC37A6P-202ENST00000448648 5444 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 SLC26A9-202ENST00000367134 4616 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 PEG10-202ENST00000482108 6618 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 NOLC1-209ENST00000605788 3932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 ADGRE1-205ENST00000450315 2567 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 SLFN13-204ENST00000526861 6004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 PRDM2-203ENST00000343137 5797 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 ERC1-202ENST00000355446 5796 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 HSPG2-203ENST00000374695 14327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 LINC02099-202ENST00000522158 2980 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 ARPP21-207ENST00000417925 3086 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 NUP155-201ENST00000231498 8143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 MAGEC1-201ENST00000285879 4270 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 ZHX3-211ENST00000544979 3933 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 LYZ-201ENST00000261267 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
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