Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D6

ARFGEF1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1Q9Y6D6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARFGEF1Q9Y6D6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms