Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
LINC00312Q9Y6C7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms