Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W3

KLF2, Krueppel-like factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF2Q9Y5W3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
KLF2Q9Y5W3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLF2Q9Y5W3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLF2Q9Y5W3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLF2Q9Y5W3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLF2Q9Y5W3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLF2Q9Y5W3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLF2Q9Y5W3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLF2Q9Y5W3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLF2Q9Y5W3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLF2Q9Y5W3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLF2Q9Y5W3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLF2Q9Y5W3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLF2Q9Y5W3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KLF2Q9Y5W3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLF2Q9Y5W3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLF2Q9Y5W3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLF2Q9Y5W3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLF2Q9Y5W3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLF2Q9Y5W3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLF2Q9Y5W3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLF2Q9Y5W3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KLF2Q9Y5W3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms