Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3S2

ZNF330, Zinc finger protein 330, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF330Q9Y3S2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF330Q9Y3S2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms