Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X7

GIT1, ARF GTPase-activating protein GIT1, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIT1Q9Y2X7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GIT1Q9Y2X7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GIT1Q9Y2X7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GIT1Q9Y2X7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GIT1Q9Y2X7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GIT1Q9Y2X7 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GIT1Q9Y2X7 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GIT1Q9Y2X7 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GIT1Q9Y2X7 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GIT1Q9Y2X7 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GIT1Q9Y2X7 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GIT1Q9Y2X7 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GIT1Q9Y2X7 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GIT1Q9Y2X7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GIT1Q9Y2X7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GIT1Q9Y2X7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GIT1Q9Y2X7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GIT1Q9Y2X7 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms