Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MED16Q9Y2X0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms