Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y297

BTRC, F-box/WD repeat-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BTRCQ9Y297 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BTRCQ9Y297 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BTRCQ9Y297 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BTRCQ9Y297 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BTRCQ9Y297 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BTRCQ9Y297 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BTRCQ9Y297 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BTRCQ9Y297 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BTRCQ9Y297 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BTRCQ9Y297 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BTRCQ9Y297 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BTRCQ9Y297 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BTRCQ9Y297 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BTRCQ9Y297 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BTRCQ9Y297 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BTRCQ9Y297 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BTRCQ9Y297 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BTRCQ9Y297 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
BTRCQ9Y297 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BTRCQ9Y297 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BTRCQ9Y297 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BTRCQ9Y297 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BTRCQ9Y297 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BTRCQ9Y297 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BTRCQ9Y297 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BTRCQ9Y297 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
BTRCQ9Y297 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BTRCQ9Y297 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BTRCQ9Y297 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BTRCQ9Y297 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BTRCQ9Y297 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BTRCQ9Y297 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BTRCQ9Y297 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BTRCQ9Y297 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
BTRCQ9Y297 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BTRCQ9Y297 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BTRCQ9Y297 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
BTRCQ9Y297 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BTRCQ9Y297 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BTRCQ9Y297 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BTRCQ9Y297 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BTRCQ9Y297 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BTRCQ9Y297 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BTRCQ9Y297 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BTRCQ9Y297 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BTRCQ9Y297 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
BTRCQ9Y297 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BTRCQ9Y297 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
BTRCQ9Y297 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BTRCQ9Y297 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BTRCQ9Y297 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BTRCQ9Y297 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BTRCQ9Y297 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BTRCQ9Y297 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BTRCQ9Y297 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BTRCQ9Y297 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BTRCQ9Y297 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
BTRCQ9Y297 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BTRCQ9Y297 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms