Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRAK1Q9UPV9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms