Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ3

BARX2, Homeobox protein BarH-like 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARX2Q9UMQ3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BARX2Q9UMQ3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BARX2Q9UMQ3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BARX2Q9UMQ3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BARX2Q9UMQ3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BARX2Q9UMQ3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BARX2Q9UMQ3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BARX2Q9UMQ3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BARX2Q9UMQ3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BARX2Q9UMQ3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BARX2Q9UMQ3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BARX2Q9UMQ3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BARX2Q9UMQ3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BARX2Q9UMQ3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BARX2Q9UMQ3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BARX2Q9UMQ3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BARX2Q9UMQ3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BARX2Q9UMQ3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BARX2Q9UMQ3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BARX2Q9UMQ3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BARX2Q9UMQ3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BARX2Q9UMQ3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BARX2Q9UMQ3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BARX2Q9UMQ3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BARX2Q9UMQ3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BARX2Q9UMQ3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BARX2Q9UMQ3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BARX2Q9UMQ3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BARX2Q9UMQ3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BARX2Q9UMQ3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BARX2Q9UMQ3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BARX2Q9UMQ3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BARX2Q9UMQ3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BARX2Q9UMQ3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BARX2Q9UMQ3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BARX2Q9UMQ3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BARX2Q9UMQ3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BARX2Q9UMQ3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BARX2Q9UMQ3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BARX2Q9UMQ3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BARX2Q9UMQ3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BARX2Q9UMQ3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BARX2Q9UMQ3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BARX2Q9UMQ3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BARX2Q9UMQ3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BARX2Q9UMQ3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BARX2Q9UMQ3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BARX2Q9UMQ3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BARX2Q9UMQ3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BARX2Q9UMQ3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BARX2Q9UMQ3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BARX2Q9UMQ3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BARX2Q9UMQ3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BARX2Q9UMQ3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BARX2Q9UMQ3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BARX2Q9UMQ3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BARX2Q9UMQ3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BARX2Q9UMQ3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BARX2Q9UMQ3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BARX2Q9UMQ3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BARX2Q9UMQ3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BARX2Q9UMQ3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BARX2Q9UMQ3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BARX2Q9UMQ3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BARX2Q9UMQ3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BARX2Q9UMQ3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BARX2Q9UMQ3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BARX2Q9UMQ3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BARX2Q9UMQ3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BARX2Q9UMQ3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BARX2Q9UMQ3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BARX2Q9UMQ3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BARX2Q9UMQ3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BARX2Q9UMQ3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BARX2Q9UMQ3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BARX2Q9UMQ3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BARX2Q9UMQ3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BARX2Q9UMQ3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BARX2Q9UMQ3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BARX2Q9UMQ3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BARX2Q9UMQ3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BARX2Q9UMQ3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BARX2Q9UMQ3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BARX2Q9UMQ3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BARX2Q9UMQ3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BARX2Q9UMQ3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BARX2Q9UMQ3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BARX2Q9UMQ3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BARX2Q9UMQ3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BARX2Q9UMQ3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BARX2Q9UMQ3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BARX2Q9UMQ3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BARX2Q9UMQ3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BARX2Q9UMQ3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BARX2Q9UMQ3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BARX2Q9UMQ3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BARX2Q9UMQ3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BARX2Q9UMQ3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BARX2Q9UMQ3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BARX2Q9UMQ3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms