Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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