Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATPIF1Q9UII2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms