Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYTH4Q9UIA0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms