Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTNAP2Q9UHC6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTNAP2Q9UHC6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms