Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXO40Q9UH90 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO40Q9UH90 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms