Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HMGXB4Q9UGU5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms